講演詳細

微生物部門[Forest Microbes]

日付	ポスター発表
会場名	（学生ポスター賞の審査対象）
講演番号	P-446
発表題目	スギ林の異なる基質が根圏におけるアンモニア酸化アーキア群集に与える影響 Effects of different substrates on rhizospheric ammonia-oxidizing archaeal communities in Japanese cedar forests.
要旨本文	森林生態系では窒素(N)が不足しており，細根周辺でのN循環の理解が重要である．森林土壌のN循環において，硝化の第一段階であるアンモニアから亜硝酸への酸化反応には，アンモニア酸化遺伝子(amoA)が関与する．その反応には細菌だけでなく，アーキアも関わることが示唆された．本研究では，人工林におけるアーキアの硝化作用への寄与を解明するため，スギ細根系におけるamoAの存在量と多様性を 調べた．北海道から台湾の人工林8林分において，各調査地1 ha内の3地点からスギ細根を含む土壌を採取した．得られた試料は土壌，スギの根圏土壌と細根に分けてDNA抽出を行い，リアルタイムPCR法でアーキアと細菌のamoA遺伝子を定量した．根圏土壌のアーキアのamoA配列はクローンライブラリー法でDNA配列を読み取り，最尤法により系統樹を作成した．その結果，根圏土壌におけるアーキアと細菌のamoA比は，低pHほど高くなる傾向にあった．系統樹推定から，アーキアのamoA配列は既知の分類群と異なるクレードを形成した．発表ではアーキアと細菌の硝化おける相対的な寄与と系統関係を，生息場所における環境条件と関連づけて決定要因を考察したい．
著者氏名	○大上楽 ・ 北上雄大 ・ 松田陽介
著者所属	三重大学大学院生物資源学研究科
キーワード	リアルタイムPCR, クローンニング, サンガーシークエンシング
Key word	real-time PCR, cloning, Sanger sequencing